現在、木祖村の農業において耕作者の高齢化や後継者不足が課題となっています。今後これらが進行することによって、野生鳥獣被害の増加や耕作放棄地の拡大が懸念されます。課題解決のためには、人材の確保や担い手の育成、遊休農地の解消、一層の野生鳥獣被害防止対策が急務となっています。

木祖村は長野県の南西部に位置し、木曽川の最上流にある農山村です。標高が約1,000mと高く、冷涼な気候を活かした「御嶽はくさい」や「とうもろこし」といった高原野菜の栽培が盛んです。そのほかにも「和牛」「そば」「雑穀」等が振興され、従来からの水稲と組み合わせた複合経営が行われています。